A finales del siglo XIX, se confirió un nuevo aspecto al refectorio con la construcción de la bóveda y los revestimientos murales que pueden observarse en la actualidad, y también con la creación de un mobiliario específico para el espacio. Se proyectó el púlpito para la hermana lectora, los bancos corridos de madera, los tableros de granito artificial y, por último, la reja de madera con motivos neogóticos que, aún hoy, separa el De Profundis y el comedor.

Durante unas obras de intervención arquitectónica del año 2010, se pudo observar el extradós de la bóveda construida en la década de 1890 por el arquitecto Joan Martorell i Montells. La bóveda, tal y como se aprecia en la imagen, descansa directamente sobre el muro medieval, en el cual puede verse el empuje de las vigas y los canes de madera que se conservaban muy probablemente hasta esta intervención. 

A los pies del refectorio, separado por un cierre monumental de madera de inspiración neogótica, se sitúa el espacio conocido como De Profundis, que funciona de distribuidor hacia la cocina, la enfermería, el claustro y el ámbito destinado a comedor propiamente dicho. A ambos lados de este espacio, se observan unos armarios de madera, obra del proyecto del siglo XIX, decorados interiormente con azulejos blancos y de muestra de los siglos XVII y XVIII.

Aparte del revestimiento interior de los muros del refectorio simulando un paramento regular de sillares, las ventanas del muro occidental también fueron modificadas. Así, tanto la forma como el revoque de mortero que las definen son fruto de la intervención de finales del siglo XIX.