La sala del Ángel tenía en origen tres accesos: uno desde el claustro, otro desde el coro alto de la iglesia y el tercero abierto al muro más septentrional, que comunicaba con el exterior. El acceso desde el claustro a este espacio se realiza a través de un gran arco adovelado de piedra, que probablemente formaba parte del primigenio proyecto arquitectónico medieval, que debía tener prevista la construcción del primer piso del claustro y «la escalera de la Reina». Esta última tenía que permitir el acceso no tan solo a este ámbito, sino también a toda la planta piso, desde el nivel inferior del claustro.

Pese a las modificaciones sufridas por la sala del Ángel a lo largo del tiempo, su relación estructural con la iglesia, con la que comparte sincronía constructiva, parece ser que indica algún tipo de dependencia vinculada, probablemente, a las necesidades tempranas del cenobio. Esta relación estructural entre sendos espacios es visible a través de la puerta adovelada de piedra que comunica la sala con el coro alto de la iglesia.

Esta puerta, localizada en el muro nordeste de la sala del Ángel, se configuraba en origen como el acceso al camino real. Realizada en piedra con arco de medio punto adovelado, marcaba también el límite entre la clausura y el exterior del cenobio.

En algún momento indeterminado del siglo XIV debió de producirse la primera transformación de este espacio, con la construcción de las dos bóvedas por arista que cubren la sala. La fisonomía de estos elementos se puede relacionar, tanto por el tipo de trabajo como por la decoración esculpida en la clave y las ménsulas, con las bóvedas del coro bajo de la iglesia.

Por encima de las bóvedas por arista que cubren la sala del Ángel, se desarrolla un segundo nivel donde se observan dos arcos apuntados, uno de ellos actualmente cegado. La presencia de estos arcos entre el muro de la iglesia y la estructura de contrafuertes de la sala indica la probable existencia de una nave de gran altura que debía de funcionar como paso de circulación entre una de las antiguas puertas de acceso al monasterio, el coro alto y el bajo.

En la actualidad —y fruto de las reformas del siglo XVI—, en el espacio entre los contrafuertes que forman la estructura de la sala del Ángel se encuentran varias habitaciones y celdas, a las que se accede mediante dos escaleras: una con bóveda tabicada y otra de espiral. Ambas son visibles desde el ámbito constituido por el antiguo dormitorio (hoy sala de exposiciones), adosado a la sala del Ángel.